Esse setor possui quatro canis, sendo dois experimentais (canis 1 e 4) e dois de manutenção (canis 2 e 3).

• Canil 1: constituido por duas alas com 24 baias individuais cada uma. Todas as baias possuem area fechada e solário, bebedouro automático e comedouro de inox. Possui, também, área coletiva para recreação e socialização dos animais; sala de banho e tosa; enfermaria; sala de pesagem e manipulação de amostras; dormitório e banheiro.
• Canil 2: são 3 baias coletivas com area coberta e piquete para recreação e socialização dos animais.
• Canil 3: nesse canil são 6 baias coletivas com area coberta e piquete para recreação.
• Canil 4: constituído por três módulos independentes. Os módulos 1 e 2 contêm, cada um, 20 baias individuais, com bebedouro automático, comedouro de inox e solário. Ambos os módulos possuem area aberta para recreação e socialização dos animais. O terceiro modulo compreende os seguintes ambientes: recepção, vestiário, banho e tosa, enfermaria, pesagem e manipulação de amostras.